Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PctpP53808 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PctpP53808 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PctpP53808 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PctpP53808 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PctpP53808 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PctpP53808 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PctpP53808 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PctpP53808 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PctpP53808 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PctpP53808 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PctpP53808 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PctpP53808 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PctpP53808 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PctpP53808 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PctpP53808 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PctpP53808 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PctpP53808 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms