Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfP51642 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfP51642 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfP51642 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfP51642 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfP51642 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfP51642 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfP51642 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfP51642 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfP51642 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfP51642 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfP51642 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfP51642 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfP51642 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfP51642 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfP51642 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfP51642 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfP51642 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfP51642 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfP51642 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfP51642 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfP51642 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CntfP51642 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfP51642 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfP51642 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfP51642 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfP51642 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfP51642 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfP51642 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfP51642 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfP51642 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfP51642 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfP51642 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfP51642 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfP51642 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfP51642 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfP51642 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfP51642 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CntfP51642 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfP51642 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfP51642 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CntfP51642 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfP51642 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfP51642 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfP51642 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CntfP51642 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CntfP51642 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfP51642 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfP51642 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfP51642 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfP51642 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CntfP51642 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CntfP51642 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CntfP51642 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms