Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa-rs12P50716 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa-rs12P50716 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms