Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa6P50704 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Defa6P50704 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms