Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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PtpreP49446 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PtpreP49446 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PtpreP49446 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpreP49446 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpreP49446 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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