Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HpdP49429 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HpdP49429 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpdP49429 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpdP49429 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpdP49429 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpdP49429 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpdP49429 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpdP49429 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpdP49429 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpdP49429 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HpdP49429 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpdP49429 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpdP49429 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HpdP49429 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HpdP49429 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HpdP49429 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HpdP49429 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HpdP49429 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HpdP49429 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HpdP49429 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HpdP49429 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HpdP49429 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HpdP49429 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HpdP49429 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HpdP49429 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HpdP49429 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpdP49429 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpdP49429 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpdP49429 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpdP49429 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpdP49429 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpdP49429 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpdP49429 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpdP49429 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpdP49429 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpdP49429 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HpdP49429 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpdP49429 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpdP49429 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HpdP49429 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms