Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc3P49135 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ercc3P49135 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms