Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prox1P48437 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms