Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox2P48432 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox2P48432 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox2P48432 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox2P48432 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox2P48432 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox2P48432 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms