Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbx2P48031 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbx2P48031 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms