Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms