Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nedd4P46935 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nedd4P46935 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms