Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sipa1P46062 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sipa1P46062 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms