Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf5P43027 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf5P43027 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf5P43027 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf5P43027 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf5P43027 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf5P43027 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf5P43027 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf5P43027 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf5P43027 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf5P43027 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf5P43027 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf5P43027 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms