Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sept1P42209 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sept1P42209 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sept1P42209 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sept1P42209 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sept1P42209 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sept1P42209 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sept1P42209 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sept1P42209 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sept1P42209 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sept1P42209 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sept1P42209 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sept1P42209 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sept1P42209 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sept1P42209 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sept1P42209 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sept1P42209 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sept1P42209 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sept1P42209 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms