Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TfamP40630 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TfamP40630 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TfamP40630 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TfamP40630 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TfamP40630 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TfamP40630 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TfamP40630 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TfamP40630 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TfamP40630 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TfamP40630 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TfamP40630 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TfamP40630 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TfamP40630 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TfamP40630 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TfamP40630 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TfamP40630 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TfamP40630 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TfamP40630 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TfamP40630 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TfamP40630 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TfamP40630 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TfamP40630 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TfamP40630 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TfamP40630 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TfamP40630 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TfamP40630 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TfamP40630 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TfamP40630 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TfamP40630 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TfamP40630 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TfamP40630 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TfamP40630 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TfamP40630 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TfamP40630 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TfamP40630 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms