Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Traf2P39429 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Traf2P39429 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf2P39429 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf2P39429 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf2P39429 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf2P39429 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf2P39429 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Traf2P39429 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms