Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nedd8P29595 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd8P29595 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms