Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp2P29594 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casp2P29594 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp2P29594 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casp2P29594 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp2P29594 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Casp2P29594 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Casp2P29594 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms