Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PrkcdP28867 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms