Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprmP28828 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprmP28828 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtprmP28828 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprmP28828 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprmP28828 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprmP28828 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprmP28828 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprmP28828 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprmP28828 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprmP28828 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprmP28828 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprmP28828 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprmP28828 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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