Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hoxd9P28357 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hoxd9P28357 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hoxd9P28357 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd9P28357 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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