Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjc1P28229 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms