Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpbP27790 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpbP27790 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpbP27790 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpbP27790 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CenpbP27790 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpbP27790 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms