Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cd40lgP27548 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms