Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CftrP26361 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CftrP26361 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CftrP26361 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CftrP26361 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CftrP26361 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CftrP26361 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CftrP26361 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CftrP26361 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CftrP26361 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CftrP26361 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CftrP26361 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CftrP26361 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CftrP26361 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CftrP26361 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CftrP26361 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CftrP26361 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CftrP26361 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CftrP26361 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CftrP26361 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CftrP26361 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CftrP26361 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CftrP26361 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CftrP26361 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CftrP26361 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CftrP26361 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CftrP26361 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CftrP26361 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CftrP26361 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CftrP26361 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CftrP26361 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CftrP26361 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CftrP26361 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CftrP26361 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CftrP26361 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CftrP26361 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CftrP26361 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CftrP26361 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CftrP26361 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CftrP26361 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CftrP26361 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CftrP26361 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CftrP26361 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CftrP26361 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CftrP26361 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CftrP26361 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CftrP26361 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CftrP26361 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CftrP26361 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CftrP26361 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CftrP26361 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CftrP26361 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CftrP26361 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CftrP26361 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CftrP26361 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CftrP26361 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CftrP26361 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CftrP26361 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CftrP26361 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CftrP26361 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CftrP26361 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CftrP26361 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CftrP26361 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CftrP26361 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CftrP26361 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CftrP26361 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CftrP26361 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CftrP26361 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CftrP26361 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CftrP26361 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CftrP26361 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CftrP26361 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CftrP26361 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CftrP26361 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CftrP26361 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CftrP26361 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CftrP26361 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CftrP26361 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CftrP26361 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CftrP26361 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CftrP26361 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CftrP26361 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CftrP26361 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CftrP26361 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms