Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna1P26231 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms