Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou3f1P21952 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou3f1P21952 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms