Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcb1aP21447 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms