Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klra1P20937 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klra1P20937 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klra1P20937 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms