Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsdP18242 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsdP18242 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsdP18242 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtsdP18242 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsdP18242 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms