Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxb1P17919 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxb1P17919 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hoxb1P17919 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxb1P17919 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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