Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f1P17208 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou4f1P17208 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms