Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf271P15620 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf271P15620 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf271P15620 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf271P15620 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf271P15620 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf271P15620 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf271P15620 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf271P15620 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms