Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Myf6P15375 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myf6P15375 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myf6P15375 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myf6P15375 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myf6P15375 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myf6P15375 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myf6P15375 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myf6P15375 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myf6P15375 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myf6P15375 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myf6P15375 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myf6P15375 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myf6P15375 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myf6P15375 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Myf6P15375 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myf6P15375 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myf6P15375 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms