Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-D1P14427 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms