Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga5P11688 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga5P11688 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms