Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nid1P10493 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nid1P10493 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms