Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb2P0C1T1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxb2P0C1T1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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