Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa9P09631 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms