Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LtaP09225 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LtaP09225 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtaP09225 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtaP09225 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtaP09225 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtaP09225 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtaP09225 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtaP09225 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtaP09225 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtaP09225 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtaP09225 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtaP09225 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtaP09225 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtaP09225 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtaP09225 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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