Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa6P09092 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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