Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb1P04202 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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