Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01853 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01853 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01853 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01853 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01853 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01853 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01853 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01853 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01853 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01853 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01853 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01853 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01853 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01853 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01853 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01853 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01853 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01853 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01853 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P01853 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P01853 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01853 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01853 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01853 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01853 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01853 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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