Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Casp8O89110 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Casp8O89110 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Casp8O89110 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms