Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sypl2O89104 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sypl2O89104 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms