Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcnkO88874 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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