Protein–RNA interactions for Protein: O88870

Best1, Bestrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best1O88870 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Best1O88870 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Best1O88870 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Best1O88870 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Best1O88870 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Best1O88870 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Best1O88870 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Best1O88870 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Best1O88870 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best1O88870 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best1O88870 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best1O88870 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best1O88870 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best1O88870 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best1O88870 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Best1O88870 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Best1O88870 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms