Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a1O88207 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a1O88207 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a1O88207 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a1O88207 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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