Protein–RNA interactions for Protein: O70576

Stag3, Cohesin subunit SA-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag3O70576 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag3O70576 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag3O70576 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stag3O70576 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag3O70576 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag3O70576 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag3O70576 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag3O70576 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag3O70576 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms